BIOMOL - Laboratorio de Biodiversidad Molecular

Descripción

El Laboratorio de Biodiversidad Molecular (BIOMOL) de la ULPGC, realiza actividades vinculadas principalmente a procedimientos y protocolos de ADN con los Secuenciadores ABI 3500 APPLIED BIOSYSTEMS y Nanopore (MinION). El laboratorio suministra apoyo y asesoramiento científico-técnico en el ámbito de la investigación en Biología Molecular y servicios de:  

• Extracción de ADN en muestras de organismos animales y vegetales, aguas y sedimentos 
• Amplificación de ADN  
• Purificación productos PCR y secuenciación SANGER 
• Genotipado 
• Trazabilidad de productos mediante RFLP 
• Real Time qPCR 
• Secuenciación (SANGER y Nanopore-MinION)

Las instalaciones del Laboratorio BioMol de la ULPGC, creado en el año 2014 y situado en el Campus Universitario de Tafira, cuentan con una superficie de 75 metros cuadrados y una infraestructura experimental que incluye varias salas y zonas diferenciadas para los análisis y estudios genéticos/moleculares de especies o taxa de la Biodiversidad y trazabilidad de productos naturales..  En las instalaciones se ubica el Banco Genético de Organismos Marinos BANGEMAC que dispone de más de 7500 muestras de tejidos y ADN de Macaronesia y otras localizaciones.

La infraestructura del laboratorio está diseñada para la recepción, pretratamiento, protocolos y análisis de muestras de organismos y adecuada para los estudios genéticos, ya que está compartimentada en diferentes zonas de trabajo, tratamiento de muestras pre y post extracción y amplificación, secuenciación.

El Laboratorio BIOMOL dispone del equipamiento técnico necesario para la realización de análisis genéticos de taxa y los programas informáticos para los análisis de los datos. 

Equipo y localización

Localización

Laboratorio BIOMOL  

C/Camino de Salvago s/n. Campus de Tafira Universidad de Las Palmas de Gran Canaria. Las Palmas de Gran Canaria – 35017

28º04´33 N/15º27´17 W

Directora del Servicio BIOMOL

Dra. Nieves Elvira González Henríquez. Investigadora Asociada.

Técnico apoyo (Personal PAS)

Equipamiento 

Secuenciador Applied Biosystems 3500

Analizador genético equipado con software para las aplicaciones de análisis de fragmentos y análisis de secuenciación. 

Novedosa interfaz de usuario para el análisis primario y en tiempo real de los datos durante los corridos electroforéticos, mediante el software Data Collection, que permite tomar decisiones sobre la calidad de los datos mientras aún están corriendo las muestras (in-plate), sin la necesidad de esperar al final del corrido y hacer un análisis con un software secundario.

Secuenciadores Nanopore (MinION)

MinION es un minisecuenciador que utiliza la tecnología de secuenciación mediante nanoporos, mediante la cual se analiza el ADN de forma directa al empujarlo a través de un poro suspendido en una membrana. La energía necesaria para su funcionamiento se extrae de un puerto USB del ordenador al que está conectado y además dispone de su propio programa de análisis. El sistema está diseñado para detectar muestras complejas y se puede adaptar para secuenciar ADN, ARN, detectar proteínas y otras técnicas basadas en la detección por nanoporos. Entre sus múltiples aplicaciones destaca la posibilidad de utilizarlo fuera del laboratorio, permitiendo, por ejemplo, el análisis de una muestra in situ.

Termocicladores (Tiempo final PCR estándar)

Termocicladores RT-qPCR

El sistema de PCR en tiempo real StepOne™ es un instrumento de PCR en tiempo real de 48 pocillos. El sistema de PCR en tiempo real StepOne™ tiene una amplia variedad de configuraciones y con un software intuitivo de análisis de datos y control del instrumento. Al utilizar un registro óptico de tres colores basado en LED, el sistema de PCR en tiempo real StepOne™ ofrece resultados de PCR en tiempo real cuantitativos y precisos para una gran variedad de aplicaciones de investigación genómica

Carta de servicios

Las técnicas que se utilizan en los servicios ofertados son:

• Extracción de ADN a partir de diferentes muestras (sedimentos, agua, tejidos). Electroforesis en gel de agarosa: ADN genómico.
• Cuantificación mediante fotometría y fluorimetría de ADN, ARN.
• Amplificación por PCR (según el tipo de muestra se utilizarán los marcadores/gen o el solicitado por el cliente). Disponemos de cebadores universales y específicos para la identificación molecular de especies.
• Purificación de productos de PCR. Electroforesis en gel de agarosa: verificación de productos de PCR y genotipado.
• PCR en tiempo real: SYBR, cuantificación absoluta, análisis de la expresión génica, sondas TaqMan y diagnóstico molecular.
• Secuenciación automática mediante electroforesis capilar y Nanopore. Secuenciación SANGER con ABI 3500 que secuencia fragmentos de un tamaño de hasta 1.2kb, y que permite una asignación precisa de las bases. y diagnóstico molecular. Secuenciación con MinION de hasta 50 Gb.
• Genotipado o análisis del tamaño de fragmentos generados por PCR. Proporciona patrones de bandas que pueden ser específicos para cada especie o que presenten variabilidad entre los individuos de una especie. (alelos de los loci/microsatélites) y diagnóstico molecular.

Servicios:

• Secuenciación Sanger ABI 3500 y NGS con Nanopore: Determinar la secuencia de bases del ADN 
• Genotipado: Determinar presencia/ausencia de SNPs y alelos 
• Secuenciación + Genotipado
• PCR tiempo real qPCR SYBR
• PCR tiempo real qPCR TAQMAN
• Técnica RFLP: PCR de Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción 
• Clonación: Técnica para aumentar la cantidad de ADN de muestras críticas 
• PCR Tiempo Final: Amplificación mediante Reacción en Cadena de la Polimerasa 

Tarifa 

 Impuesto General Indirecto Canario no incluido

* El servicio BIOMOL se encarga de la realización de todos los procesos que conlleven el procesado para el análisis final de las muestras. El cliente proporcionará las muestras según las indicaciones que se le proporcionen cuando se haga el encargo. Todos los Servicios se realizan con la entrega de un Informe detallado de resultados.

* La bioinformática del Análisis de NGS de Nanopore se presupuestará aparte del precio de secuenciación.

* Para encargos de un número elevado de muestras se hará un descuento. 

* Tarifas aprobadas por el Consejo Social de la ULPGC. N.º de Certificado: 1634. Fecha: 05/07/2023.